Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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BC030500E9Q6W0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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BC030500E9Q6W0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC030500E9Q6W0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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