Protein–RNA interactions for Protein: E9Q355

Catsperg1, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg1E9Q355 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Catsperg1E9Q355 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Catsperg1E9Q355 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Catsperg1E9Q355 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Catsperg1E9Q355 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Catsperg1E9Q355 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Catsperg1E9Q355 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Catsperg1E9Q355 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Catsperg1E9Q355 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Catsperg1E9Q355 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Catsperg1E9Q355 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Catsperg1E9Q355 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms