Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl3lE9PWZ3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl3lE9PWZ3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl3lE9PWZ3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl3lE9PWZ3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl3lE9PWZ3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl3lE9PWZ3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl3lE9PWZ3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl3lE9PWZ3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl3lE9PWZ3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl3lE9PWZ3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl3lE9PWZ3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl3lE9PWZ3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl3lE9PWZ3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl3lE9PWZ3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl3lE9PWZ3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl3lE9PWZ3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl3lE9PWZ3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl3lE9PWZ3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms