Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp6ap1lD3Z5W0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms