Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc8D3YZV8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms