Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YW32

Ighv1-37, Immunoglobulin heavy variable 1-37 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-37A0A0A6YW32 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv1-37A0A0A6YW32 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv1-37A0A0A6YW32 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms