Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF18Q9Y5U5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF18Q9Y5U5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms