Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lhx9Q9WUH2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhx9Q9WUH2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms