Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms