Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3EQ9NVU0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms