Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
DMRT3Q9NQL9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DMRT3Q9NQL9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms