Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkd2l2Q9JLG4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms