Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms