Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

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Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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SacsQ9JLC8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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SacsQ9JLC8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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SacsQ9JLC8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SacsQ9JLC8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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