Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmx1aQ9JKU8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms