Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ldb3Q9JKS4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ldb3Q9JKS4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms