Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl11Q9JHH5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms