Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a2Q9EQR4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3a2Q9EQR4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms