Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1lQ9EQ00 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms