Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms