Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms