Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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