Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2af1Q9D883 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms