Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G3

2900055J20Rik, RIKEN cDNA 2900055J20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2900055J20RikQ9D6G3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms