Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms