Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Odf2lQ9D478 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Odf2lQ9D478 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Odf2lQ9D478 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Odf2lQ9D478 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Odf2lQ9D478 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Odf2lQ9D478 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2lQ9D478 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2lQ9D478 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2lQ9D478 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2lQ9D478 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2lQ9D478 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Odf2lQ9D478 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf2lQ9D478 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms