Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P5

Pygo1, Pygopus homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pygo1Q9D0P5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pygo1Q9D0P5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pygo1Q9D0P5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pygo1Q9D0P5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms