Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nde1Q9CZA6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms