Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Xrcc3Q9CXE6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Xrcc3Q9CXE6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Xrcc3Q9CXE6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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