Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms