Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms