Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gtf2a1Q99PM3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf2a1Q99PM3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms