Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MEIS3Q99687 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms