Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRERF1Q96PN7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRERF1Q96PN7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRERF1Q96PN7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRERF1Q96PN7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRERF1Q96PN7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRERF1Q96PN7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRERF1Q96PN7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRERF1Q96PN7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRERF1Q96PN7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRERF1Q96PN7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRERF1Q96PN7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRERF1Q96PN7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRERF1Q96PN7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRERF1Q96PN7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRERF1Q96PN7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms