Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTERF3Q96E29 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms