Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms