Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FRAT1Q92837 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FRAT1Q92837 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FRAT1Q92837 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FRAT1Q92837 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRAT1Q92837 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRAT1Q92837 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRAT1Q92837 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRAT1Q92837 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FRAT1Q92837 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FRAT1Q92837 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FRAT1Q92837 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRAT1Q92837 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FRAT1Q92837 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FRAT1Q92837 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FRAT1Q92837 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FRAT1Q92837 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FRAT1Q92837 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FRAT1Q92837 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
FRAT1Q92837 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FRAT1Q92837 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FRAT1Q92837 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FRAT1Q92837 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FRAT1Q92837 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
FRAT1Q92837 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FRAT1Q92837 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FRAT1Q92837 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRAT1Q92837 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRAT1Q92837 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRAT1Q92837 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
FRAT1Q92837 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FRAT1Q92837 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRAT1Q92837 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRAT1Q92837 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRAT1Q92837 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FRAT1Q92837 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRAT1Q92837 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FRAT1Q92837 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRAT1Q92837 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FRAT1Q92837 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FRAT1Q92837 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRAT1Q92837 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FRAT1Q92837 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FRAT1Q92837 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FRAT1Q92837 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FRAT1Q92837 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
FRAT1Q92837 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRAT1Q92837 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms