Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn16Q925N4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms