Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atpaf2Q91YY4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atpaf2Q91YY4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atpaf2Q91YY4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atpaf2Q91YY4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atpaf2Q91YY4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atpaf2Q91YY4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atpaf2Q91YY4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atpaf2Q91YY4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atpaf2Q91YY4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atpaf2Q91YY4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atpaf2Q91YY4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atpaf2Q91YY4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atpaf2Q91YY4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atpaf2Q91YY4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atpaf2Q91YY4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atpaf2Q91YY4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atpaf2Q91YY4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms