Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp3Q8R4B8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp3Q8R4B8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms