Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc8Q8CFD5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ercc8Q8CFD5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ercc8Q8CFD5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc8Q8CFD5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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