Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN6

Txnl1, Thioredoxin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnl1Q8CDN6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Txnl1Q8CDN6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Txnl1Q8CDN6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms