Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

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Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek5Q7TSC3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek5Q7TSC3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek5Q7TSC3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek5Q7TSC3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms