Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2BQ7L1I2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms