Protein–RNA interactions for Protein: Q6T3U4

Npc1l1, Niemann-Pick C1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1l1Q6T3U4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Npc1l1Q6T3U4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms