Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2lQ6PDS0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm2lQ6PDS0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms