Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic1Q6NXK8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Asic1Q6NXK8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms