Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms