Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spty2d1Q68FG3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spty2d1Q68FG3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Spty2d1Q68FG3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms