Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga3Q62470 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms